Ponieważ brak jest w tym temacie jakichkolwiek odpowiedzi, a w międzyczasie znalazłem rozwiązanie, poniżej podrzucam - może się komuś przyda:

Dla obecnej Kuneny 2.0.4:
w pliku: components/com_kunena/template/blue_eagle/html/topic/edit.php
w linii 173
Kod PHP:
<input type="checkbox" name="subscribeMe" id="subscribeMe" value="1" <?php if ($this->subscriptionschecked == 1) echo 'checked="checked"' ?> />
usunąć
Kod PHP:
checked="checked" 
Pozdrawiam serdecznie