Zrobilbym tak, ponieważ sama nowa instalaka Joomli Ci pewno nie wystarczy, ze bym skopiowial serwis do jakiegos podkatalogu i tam nadpisal pliki Joomla, dzięki temu bedziesz mial nadal wszystkie moduly itd, i bedziesz mogl sprawdzic co Ci chodzi pod Joomla z zainstalowanych dodatkow a co nie, oczywiscie mozesz to podpiac po ta sama baze